Самая первая публикация — фрагмент сказочной повести «Метрольцы» — состоялась в 2006 г. в № 2 журнала «Автобус» по результатам 1-го конкурса «Новая проза для наших детей». Первая книга «Метрольцы. Приключения Юньки» вышла в 2010 г. в издательстве «Настя и Никита». В этом же году было опубликовано продолжение «Метрольцы. Возвращение Юньки». В 2015 г. издательство «Аквилегия-М» опубликовало сказочную повесть «Пуговка на траве», в 2017 г. там же — «Тропоброд, Рыжик и другие».

В 2013 г. сказочная повесть «Метрольцы» заняла 1-е место в Независимом книжном конкурсе «Книга года: выбирают дети» (проект Культурно-образовательного фонда «Настоящее детство») в номинации «Выбор детей 2-3 класса». Книга получила официальное право ставить знак победителя конкурса «Лучшая книга 2013: выбор детей» при её переизданиях. В 2015 г. Мария Агапова получила диплом финалиста Международной детской литературной премии им. В. П. Крапивина (учреждена Содружеством детских писателей) за повесть «Путь тропоброда», а в 2018 г. – диплом финалиста этой же премии за повесть «Моя невозможная мама».